ỨNG DỤNG ĐIỆN DI SDS-PAGE ĐỂ ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA CÁC ĐÀN CÁ TRA Pangasianodon hypophthalmus BỐ MẸ Ở ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG
Abstract
Nghiên cứu được thực hiện trên 04 đàn cá Tra (Pangasianodon hypophthlamus) bố mẹ có nguồn gốc từ: tự nhiên, Tiền Giang, Đồng Tháp và An Giang. Dựa trên phổ diện điện di để đánh giá đa dạng di truyền các quần đàn cá tra; các quần đàn cá tra được đánh giá đa dạng di truyền bằng phương pháp điện di SDS-PAGE trong mẫu máu. Kết quả điện di đồ được chụp lại bằng máy scan EPSON, phân tích bằng phần mềm GelAnlyzer2010a. Đánh giá đa dạng kiểu hình (H’), đa dạng kiểu gen (HEP) và tổng số allen hiệu quả (SENA) của các đàn cá bố mẹ. Thời gian thực hiện nghiên cứu từ tháng 4/2012 đến tháng 3/2014.
Kết quả khảo sát protein trong máu của 04 đàn cá bố mẹ cho thấy có 22 băng protein gồm 19 băng có khối lượng từ 20 kDa đến 224 kDa, có 03 băng có khối lượng cao hơn 250 kDa. Đa dạng kiểu hình H’ của 04 đàn cá: Đồng Tháp, An Giang, Tiền Giang và đàn cá tự nhiên lần lượt là 3,36; 3,55; 3,85 và 4,35. Cho thấy 03 đàn cá địa phương (Đồng Tháp, An Giang và Tiền Giang) ít đa dạng kiểu hình hơn đàn tự nhiên. Tuy nhiên, đa dạng kiểu gen HEP không khác biệt giữa các đàn cá (p>0,05); Kết quả điện di mẫu máu đàn cá cho thấy chuỗi nặng (H-chains) có khối lượng 71kDa và chuỗi nhẹ (L-chains) có khối lượng 24 kDa và 28 kDa tương đương khối lượng phân tử của kháng thể IgM. Đàn cá An Giang có quan hệ di truyền gần với Tiền Giang và đàn cá tự nhiên thì ít quan hệ di truyền với các đàn cá khác.
Từ khóa: Đa dạng di truyền, Cá tra, bố mẹ, Điện di SDS-PAGE, IgM.
References
De Woody, J.A., and J.C. Avise. 2000. Microsatellite variation in marine, freshwater and anadromous fishes compared with other animals. J. Fish Biol. 56: 461–473.
Ford JS, Myers RA. 2008. A global assessment of salmon aquaculture impacts on wild salmonids. PLoS Biol. 6(2): e33
Dương Thị Hương Giang, Edilbert Van Driessche, Sonia Beeckmans. 2011. Serum carbohydrate-binding IgM are present in Vietnamese striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) but not in North African catfish (Clarias gariepinus). Developmental and Comparative Immunology 36 (2012) 418–432.
Đặng Thị Hoàng Oanh, Đoàn Nhật Phương, Nguyễn Minh Hậu và Nguyễn Thanh Phương. 2004. Thiết lập bộ sưu tập vi khuẩn kháng thuốc kháng sinh chloramphenicol. KhoaThủy sản, Đại học Cần Thơ. Tạp chí nghiên cứu Khoa học, Đại học Cần Thơ, số 2: 152-157.
Gjedrem, T., 1997. Flesh quality improvement in fish through breeding. Aquaculture international, 5: 197-206.
Nei et al (1983) Accuracy of estimated phylogenetic trees from molecular data. Journal of Molecular Evolution, 19, 153–170.
Nguyễn Văn Sáng và ctv., 2009. Chọn giống cá tra (Pangasianodon hypophthalmus) nhằm tăng tỷ lệ phi lê bằng chọn lọc gia đình. Báo cáo tổng hợp đề tài Khoa học và Công nghệ cấp Bộ. Viện nghiên cứu nuôi trồng thủy sản II.
Peakall R, Smouse PE. GenAlEx 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Mol. Ecol. Notes. 2006;6: 288–295.
So, N., J.K.J. Van Houdt and F.A.M. Volckaert. 2006a. Genetic diversity and population history of the migratory catfishes Pangasianodon hypophthalmus and Pangasius bocourti in the Cambodian Mekong river. Fisheries Science 469-476.
