TẠO DÒNG VÀ PHÂN TÍCH TRÌNH TỰ GEN SERINE PROTEASE THỦY PHÂN FIBRIN TỪ GIUN QUẾ (Perionyx excavatus)
Abstract
Lumbrokinase của giun quế (Perionyx excavatus) là một enzyme thủy phân fibrin. Trong nghiên cứu này, cDNA mã hóa gen lumbrokinase được khuếch đại với cặp mồi đặc hiệu được thiết kế dựa vào trình tự gen mã hóa lumbrokinase trên GenBank với mã số DQ234061. Đoạn cDNA có kích thước 726 bp được tạo dòng với vector pCR®2.1. Trình tự nucleotide của cDNA được so sánh với trình tự của gen lumbrokinase của các loài giun đất Eisenia fetida (mã số DQ234061), Lumbricus bimastus (mã số AY187629) và Lumbricus rubellus (mã số U25644) trên GenBank và có độ tương đồng lần lượt là 52,02%; 50,06% và 48,03%.
Từ khóa: cDNA, lumbrokinase, giun quế (Perionyx excavatus).
References
. Nguyễn Đức Bách, Luyện Quốc Hải, Ngô Thị Hoài Thu, Lê Quang Huấn, Nguyễn Thị Ngọc Dao, Đặng Diễm Hồng, Nguyễn Văn Đồng , Tách dòng gen mã hoá cho enzym lumbrokinase từ loài Giun quế của Việt Nam (Perionyx excavatus), Báo cáo khoa học Hội nghị Công nghệ sinh học toàn quốc, (2003), 590-593.
. Võ Thị Hạnh, Lê Thị Bích Phượng, Trần Thanh Phong, Lê Thị Hương, Trương Thị Hồng Vân, Huỳnh thị Kim Hối, Sử dụng trùn quế Perionyx excavatus để sản xuất chế phẩm sinh học dùng trong nông nghiệp, Hội nghị Khoa học toàn quốc lần thứ IV Hóa sinh và Sinh học phân tử phục vụ Nông, Sinh, Y học và Công nghiệp thực phẩm, Hà nội, 15-17/10/2008, Nxb. Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội, (2008), 174-176.
. Sugimoto M and Nakajima, Molecular cloning, sequencing, and expression of cDNA encoding serine protease with fibrinolytic activity from earthworm, Biosci. Biotechnol. Biochem., 65 (7), (2001), 1575-1580.
. Cho IH, Choi ES, Lim GH, Lee HH, Purification and charaterization of six fibrinolytic serine-protease from earthworm Lumbricus rubellus, J. Biochem Mol Biol, 37 (2), (2004a), 199-205.
. Cho IH, Choi ES, Lim GH, Lee HH, Molecular cloning, sequencing, and expression of a fibrinolytic serine-protease gene from the earthworm Lumbricus rubellus, J. Biochem Mol Biol, 37 (5), (2004b), 574-581.
. Ge T, Sun ZJ, Fu SH and Liang GD, Cloning of thrombolytic enzyme (lumbrokinase) from earthworm and its expression in the yeast Pichia pastoris, Protein Expression and Purification 42, (2005), 20-28.
. Liu J, Wang X, Xu L, Zhang J, Liang D, Chang W, cDNA cloning and expression of earthworm fibrinolytic enzyme component A, Chinese Science Bulletin, Vol.48 No.1, (2003), 68-71.
. Mihara H, Sumi H, Yoneta T, Mizumoto H, Ikeda R, Seiki M and Maruyama M, A novel fibrinolytic enzyme extracted from the earthworm, Lumbricus rubellus, Japanese Journal of Physiology 41, (1991), 461-472.
. Sambrook and Russell, Molecular Cloning a laboratory manual, CSHL Press, Vol 1, 2, 3, 2001.
. Lại Thị Bích Thủy, Nguyễn Thị Ngọc Dao, Tách chiết enzyme có hoạt tính thủy phân fibrin từ một số loài giun quế Perionyx excavatus, Nghiên cứu cơ bản trong Khoa học sự sống định hướng Y dược học, Báo cáo khoa học, Hội nghị Khoa học toàn quốc, Hà nội, 2004, Nxb. Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội, (2004), 173-176.
. Lại Thị Bích Thủy, Nguyễn Trường Giang, Nguyễn Thị Ngọc Dao, Hoạt tính thủy phân fibrin của enzyme tách từ một số loài giun đất Việt Nam, Những vấn đề nghiên cứu cơ bản trong Khoa học sự sống, Báo cáo khoa học, Hội nghị Khoa học toàn quốc lần thứ hai trong nghiên cứu cơ bản trong Sinh học, Nông nghiệp, Y học, Huế, 25-27/7/2003, Nxb. Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội, (2003), 531-533.
. Phan Thị Bích Trâm, Dương Thị Hương Giang, Hà Thanh Toàn, Phan Thị Ánh Hồng, Chiết tách và tinh sạch enzyme thủy phân fibrin từ trùn quế Perionyx excavatus, Hội nghị Khoa học toàn quốc lần thứ IV Hóa sinh và Sinh học phân tử phục vụ Nông, Sinh, Y học và Công nghiệp thực phẩm, Hà nội 15-17/10/2008, Nxb. Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội, (2008a), 661-665.
. Phan Thị Bích Trâm, Dương Thị Hương Giang, Hà Thanh Toàn, Phan Thị Ánh Hồng, Khảo sát đặc điểm các serine-protease từ trùn quế Perionyx excavatus, Hội nghị Khoa học toàn quốc lần thứ IV Hóa sinh và Sinh học phân tử phục vụ Nông, Sinh, Y học và Công nghiệp thực phẩm, Hà Nội 15-17/10/2008, Nxb. Khoa học và Kỹ thuật Hà Nội, (2008b), 123-127.
. Wang F, Wang C, Li M, Gui L, Zhang J and Chang W, Purification, charaterization and crystallization, 2003.
